Moleküler Omik ve Toksikoloji Araştırma Grubu

Araştırma grubumuz, moleküler omik ve toksikolojinin entegrasyonu yoluyla karmaşık biyolojik sistemlerin anlaşılmasını ilerletmeyi hedeflemektedir. Odak noktamız iki kritik alanda yoğunlaşmaktadır: Sistem Biyotıbbı ve KanserOmik ile Mekanistik ve Gelişimsel Toksikoloji.

Hakkımızda

Misyon:
Misyonumuz, kanser ve çevresel kirleticilere karşı toksikolojik yanıtların altında yatan karmaşık biyolojik mekanizmaları çözmektir. Yenilikçi terapötik stratejilerin ve daha güvenli çevresel uygulamaların geliştirilmesine katkıda bulunmayı amaçlıyoruz. Bu hedefe, kapsamlı ve bütünsel araştırma yaklaşımları ile ulaşmayı planlıyoruz.

Araştırma Alanları:

Sistem Biyotıbbı ve KanserOmik

• • Kanser Genetiği
  • Kanser Bilişimi
  • İlaç Yeniden Konumlandırma
  • Çoklu Omik Yaklaşımlar
  • Sistem Toksikoloji

 

Genel Bakış: Bu alandaki araştırmalarımız, kanser genetiği, bilişimi ve ilaç yeniden konumlandırma stratejilerini içermektedir. Kanser genetiğini ve moleküler temellerini araştırmak için sistem biyolojisi perspektifi ve çoklu omik yaklaşımlar kullanıyoruz. Yenilikçi ilaç yeniden konumlandırma yoluyla yeni terapötik hedefler belirlemeyi ve mevcut tedavileri geliştirmeyi hedefliyoruz.

 

Temel Araştırma Alanları:

Mekanistik ve Gelişimsel Toksikoloji

• • Çevresel Kirleticiler
  • Akut ve Kronik Maruziyet
  • Transkriptomik, Metabolomik, Proteomik
  • Toksikolojik Son Noktalar (ölüm oranları, teratojenik etkiler)

 

Genel Bakış: Bu araştırmalar, plastikleştiriciler, PFAS, pestisitler, nano-/mikro-plastikler, ilaçlar ve yeni nesil bileşenler gibi potansiyel çevresel kirleticilerin zararlı etkilerine odaklanmaktadır. Bu maddeleri hem akut hem de kronik maruziyet seviyelerinde inceleyerek, transkriptomik, metabolomik ve proteomik gibi çoklu omik yaklaşımlar kullanıyoruz.

 

Temel Araştırma Alanları:

Araştırma Modelleri ve Teknikleri:

• Zebra balığı: Gelişimsel süreçler ve toksikolojik etkilerin incelenmesinde kullanılmaktadır.
• Daphnia magna: Akut toksisite ve çevresel etkilerin değerlendirilmesinde kullanılmaktadır.
• Hücre Kültürleri: Detaylı moleküler ve hücresel analizlerde kullanılmaktadır.
• Probiyotik Hücreler: Kimyasal ve ilaçların probiyotik organizmalara etkilerini incelemek için kullanılır.

 

 

Son Yayınlar:

• Turanlı, B., Gulfidan, G., Aydogan, O. O., Kula, C., Selvaraj, G., & Arga, K. Y. (2024). "Genome-scale metabolic models in translational medicine: the current status and potential of machine learning in improving the effectiveness of the models." Molecular Omics, 20(4), 234-247.
• Budak, B., Tükel, E. Y., Turanlı, B., & Kiraz, Y. (2024). "Integrated systems biology analysis of acute lymphoblastic leukemia: unveiling molecular signatures and drug repurposing opportunities." Annals of Hematology, 1-14.
• Bereketoglu, C., Häggblom, I., Turanlı, B., & Pradhan, A. (2024). "Comparative analysis of diisononyl phthalate and di (isononyl) cyclohexane‐1, 2 dicarboxylate plasticizers in regulation of lipid metabolism in 3T3‐L1 cells." Environmental Toxicology, 39(3), 1245-1257.
• Kim, Y., Bereketoglu, C., Sercinoglu, O., & Pradhan, A. (2024). "In Vitro, In Vivo, and In Silico Analysis of Pyraclostrobin and Cyprodinil and Their Mixture Reveal New Targets and Signaling Mechanisms." Chemical Research in Toxicology, 37(3), 497-512.

 

Ekibimiz

Grup Liderleri:

• Doç. Dr. Beste Turanlı
• Doç. Dr. Ceyhun Bereketoğlu

 

Doktora Öğrencileri:

• Mustafa Yavuz
• Özge Önlütürk Aydoğan

 

Yüksek Lisans Öğrencileri:

• Sena Özyiğit
• Recep Anıl Kaya
• Elif Serap Gürler

 

Lisans Öğrencileri:

• Yusuf Talha Başaran
• Tunahan Tekerek
• Aytaç Dursun Öksüzoğlu
• Nezahat Ertürk

 

İşbirlikleri ve Fonlama

İşbirlikleri:

• Prof. Mehmet Lütfi Yola, Hasan Kalyoncu Üniversitesi
• Doç. Dr. Ajay Pradhan, Örebro Üniversitesi
• Prof. Adil Mardinoglu, KTH
• Prof. Raghu Sinha, Penn State University
• Yrd.Doç.Dr.  Yağmur Kiraz, İzmir Ekonomi Üniversitesi
• Yrd.Doç.Dr. Saliha Ece Acuner, İstanbul Medeniyet Üniversitesi

 

Fonlama Kaynakları:

• Marmara Üniversitesi ADEP
• TÜBİTAK
• TÜSEB

 

Haberler ve Etkinlikler

Yaklaşan Etkinlikler:

Yakında açıklanacaktır.

Son Haberler:

Yakında açıklanacaktır.

 

İletişim

Adres:
Marmara Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, Biyomühendislik Bölümü, M2 B03, Aydınevler, Maltepe/İstanbul, Türkiye

E-posta:

beste.turanli@marmara.edu.tr
ceyhun.bereketoglu@marmara.edu.tr

 

Sosyal Medya:

• Twitter
• Facebook
• LinkedIn